呼吸器・乳腺外科独自の研修プログラムと、消化器・小児外科、心臓血管外科との合同の研修プログラムを有しています。これは、外科専門医を取得するまでは、種々の分野の手術修練の経験が必要であるからです。また、研究に主体をおいた大学院進学プログラムもあります。外科専門医取得後は、呼吸器外科専門医、乳腺外科専門医を目指したプログラムで修練を積んでゆくことになります。