検査部

微生物検査室

微生物検査とは、感染症を調べる検査です。感染症は微生物によって起こります。微生物には細菌、真菌(酵母やカビ)、ウイルスなどがあります。

微生物検査は、感染が疑われる部位から採取された様々なもの(糞便、喀痰、尿、膿分泌物、体腔液など)を検査材料として用います。提出された検査材料を培養して感染症や日和見感染の原因となる微生物を特定していきます。検査材料の採り方や保管の仕方によっても検査結果の良否が変わってきますので、患者さんのご協力をお願いいたします。

微生物検査では、検査材料を受け取ってから、感染の原因となる微生物を特定し、その微生物に対する抗菌薬の感受性(薬の効きの良さ)を測定するまでに最低3～4日を要します。また、嫌気性細菌(酸素があると発育しない細菌)や真菌(酵母やカビ)といった成長の遅い微生物などはより多くの日数を要しています。

現在微生物検査室では、結果報告をなるべく早く報告できるよう質量分析装置を導入し、当日もしくは翌日には細菌の同定結果を報告できるようになっております。

以前は結果報告までに1ヶ月以上を要していた抗酸菌(結核菌・非定型抗酸菌)検査もPCR検査の導入により、検査材料の提出後、最速で1～4時間後には抗酸菌の検出が可能になっています。

昨今、 メチシリン耐性黄色ブドウ球菌(MRSA)や多剤耐性緑膿菌(MDRP)、多剤耐性アシネトバクター(MDRA)、バンコマイシン耐性腸球菌(VRE)といった数々の薬剤耐性菌による院内感染が社会的問題となっております。当院では感染制御部と連携を取り、院内感染の発生防止に貢献できるよう努めております。

微生物とは

肉眼では判別することはできませんが、顕微鏡などで拡大することで観察できる大きさの生物のことで、細菌・ウイルス・酵母・カビなどが含まれます。

具体的には、食中毒の原因である大腸菌O-157、キャンピロバクター、ノロウイルスであったり、人食いバクテリアと呼ばれ劇症型感染症を起こすA群溶連菌や、院内感染の原因となるメチシリン耐性黄色ブドウ球菌(MRSA)、多剤耐性緑膿菌(MDRP)、多剤耐性アシネトバクター(MDRA)、バンコマイシン耐性腸球菌(VRE)などがあります。

顕微鏡画像

検査する前に

微生物は私たちヒトの皮膚表面・空気中・床や机の上・ほこりの中などのありとあらゆる場所に生息しています。

そのような環境中に生息する微生物が検査材料に混入するのを防止するため、作業の大半を安全キャビネットの中で行っています。安全キャビネットとはエアーカーテン(空気の流れでできた壁)で、外の空気が入ってこないように、また中の空気が漏れ出さないように仕切られた装置です

また、作業を行う私たちもマスクや手袋、検査の種類によってはガウンやN95マスクといった防護着を着用することで、自らの感染防止に努めています。

  • 安全キャビネット

一般細菌検査について

一般細菌とは，特定培地（標準寒天培地）を用いて３６±１℃・２４±２時間での条件下にて培養したときに培地上で増殖する細菌に対する名称のことです。特定の細菌またはグル－プを指すものではありません。

一般細菌検査の流れ

上記図の提出から報告までに３日～４日の日数を要します。

（塗抹染色）

グラム染色という方法を用いています。検査材料中の細菌の有無や菌量などが分かり、菌の大まかな分類も可能となります。グラム陽性菌であれば青紫色に、グラム陰性菌であれば赤色に染色されます。色と形の違いによって大まかな菌の種類を推定することができます。

  • グラム陽性菌
  • グラム陰性菌

（分離培養）

検査材料の種類に応じて様々な寒天培地に検査材料を塗り広げていき、その培地を約35℃の培養装置の中で20時間培養します。

検査材料中に細菌が存在していた場合には、培地の表面にコロニーと呼ばれる菌の塊が生えてきます。

（同定検査）

コロニーの色、質感、形といった肉眼的な性状、生化学的な性状、同定キット、質量分析装置、その他同定機器による検査などを行うことにより、菌名が同定されていきます。

  • 質量分析器
  • VITEK2
  • 生化学的検査用培地
  • 同定キット

（薬剤感受性検査）

感染症を引き起こす原因となった細菌に対して、どの様な抗生物質が効果的かを調べる検査です。

嫌気性菌検査について

酸素の存在しない環境下でも発育することのできる細菌の検査です。

大きく分けて酸素の存在下では生存することのできない偏性嫌気性菌と酸素の存在下でも発育することのできる通性嫌気性菌があります。

一般的な嫌気性菌検査では偏性嫌気性菌を対象としています。検査の流れとしては、一般細菌検査と同じですが、発育速度が遅いためにやや日数が掛かります。

嫌気性専用培養器(この装置の中で酸素の存在しない嫌気的な環境を作っています)

微好気性菌について

大気中よりも低い酸素濃度(２～１０％)の環境下で発育良好な細菌の検査です。代表的な菌としては、胃潰瘍の原因となるピロリ菌や胃腸炎の原因となるキャンピロバクターといった菌があります。

抗酸菌検査について

抗酸菌は大きく分けて結核菌と非定型抗酸菌に分類されます。症状としてはどちらとも咳、痰、全身倦怠感、微熱といった状態が長期に渡って続きます。

しかし、結核菌はヒトからヒトへ感染し、ヒトの体内でしか生息できないのに対して、非定型抗酸菌は環境中に生息しており、ヒトからヒトへの感染はほとんど無いと言われています。

抗酸菌は一般細菌に比べ発育が非常に遅い為に、以前は菌名が同定されるまでに1ヶ月から2ヶ月程の期間を要していました。しかし近年、遺伝子検査が導入されるようになり、当検査室では、結核菌は最速1時間程度で同定できるようになりました。

非定型抗酸菌の一部の菌種につきましても、最速3～4時間にて同定できるようになっております。

結核は過去の病という風に思われがちですが、決してそうではありません。毎年2万人を超える患者さんが新規に報告されています。

抗結核薬をきちんと飲めば治る病気ですが、病院への受診が遅れると重症化することがあります。

疑わしい症状の方は早めに近医を受診されることをお薦めします。

好酸菌検査の流れ

（塗抹染色）

蛍光染色、チール・ネルゼン染色という２種類の方法を用いています。

  • チール・ネルゼン染色
    (ピンク色の部分が抗酸菌です)
  • 蛍光染色
    (光っている部分が抗酸菌です)

（検体処理）

NALC(N-アセチル-L-システイン)-NaOH法により、抗酸菌以外の菌を除きます。

（分離培養）

小川培地、液体培地を用いています。

  • 小川培地
  • 液体培地

（遺伝子検査）

結核菌（Mycobacterium tuberculosis）／M.avium ／M.intracellulareの３菌種の同定が可能です。

LAMP法・TaqMan法の2種類の測定方法を用いて検査しています。

（感受性検査）

感染症を引き起こす原因となった好酸菌に対して、どういった抗結核薬が効果的かを調べる検査です。

真菌検査について

自然界には数万種も真菌が生息していると言われています。水まわりや食べ物に生えるカビも真菌の一種ですし、パンやお酒を作る際に用いられる酵母も真菌の一種です。そういったことからも、真菌は身近に感じることのできる微生物ではないでしょうか？

ほとんどの真菌はヒトに害を及ぼすことはありませんが、ごく一部の真菌は感染症を引き起こします。また、普段は無害であっても身体の免疫力が低下している場合には感染症を引き起こすこともあります。

真菌感染症としては、皮膚の表面や爪などに感染する（俗にいう水虫）浅在性真菌症と組織や臓器などの体内に病変を形成する深在性真菌症があります。培地に発育したコロニーの色、質感、形といった形態観察やコロニーを染色した顕微鏡画像や質量分析法などを用いて、検査を行っています。

  • 培地発育像
  • 染色像

当検査室にて実施している特殊細菌検査について

当検査室では検査の迅速化を目的として、下記のキット化された検査を実施しています。試薬を用いています。

  • A群溶連菌検査
    小児の咽頭炎の原因菌であるA群溶連菌の検査です。
  • ロタウイルス検査
    乳幼児の下痢を起こすウイルスの検査です。
  • クロシトリジオイデス(クロストリジウム)　ディフィシル毒素検査
    偽膜性腸炎の原因となるクロストリジオイデス(クロストリジウム)　ディフィシルの産生する毒素の検査です。
  • 髄液迅速検査
    髄液中の髄膜炎菌、肺炎球菌、インフルエンザ菌、B群溶連菌の有無を調べる検査です。
  • 尿中肺炎球菌検査
    肺炎の原因菌である肺炎球菌の検査です。
  • 尿中レジオネラ検査
    肺炎の原因菌であるレジオネラ菌の検査です。
  • β-D-グルカン検査
    血中のβ-D-グルカン（真菌細胞壁多糖体）を定量する検査です。
  • エンドトキシン検査
    血中のエンドトキシン（内毒素）を定量する検査です。
  • アデノウイルス検査
    鼻腔ぬぐい液、咽頭ぬぐい液中に咽頭結膜炎や肺炎などの原因であるアデノウイルスの有無を調べる検査です。
  • RSウイルス検査
    鼻腔ぬぐい液、鼻腔吸引液中に乳幼児の冬かぜ(細気管支炎や肺炎)の原因であるRSウイルスの有無を調べる検査です。

遺伝子関連検査

遺伝子関連検査には、大きく分けて遺伝学的検査、遺伝子検査、核酸検査があり、微生物検査室では核酸検査を行っております。

核酸検査とは、感染症の原因微生物のDNA検査、RNA検査などヒト以外の遺伝情報を明らかにする検査です。検査材料中に感染症の原因微生物の遺伝情報があるか、どのくらいの量の原因微生物が存在するのかなどを調べます。

当検査室では下記の核酸検査を行っております。

  • HBV核酸定量検査
    血液中のB型肝炎ウイルスを定量するPCR検査です。
  • HCV核酸定量検査
    血液中のC型肝炎ウイルスを定量するPCR検査です。
  • 新型コロナウイルスPCR検査
    新型コロナウイルス(SARS-CoV-2)の有無を調べるPCR検査です。
遺伝子